Wie Sie schon vermuten: Ein Filter wird nur dann aktiv, wenn die Filterfrage im Fragebogen abgefragt wird.
Es gibt hier zwei Möglichkeiten:
1) Sie können mit PHP-Filtern arbeiten. Ich würde dieses Vorgehen empfehlen, weil es m.E. besser strukturiert ist und weniger Fehler passieren, wenn man nachträglich irgendwo etwas ändert.
2) Sie können in der Frage auf Seite 1 auch gleich noch "ausblenden"-Filter für die Fragen auf Seite 3 hinterlegen.