SoSci Survey liefert Ihnen am Ende die einzelnen Antworten als Datensatz - für die Auswertung macht es dann relativ wenig Unterschied, ob Sie ...
... alle Items in einer großen Skala anlegen, und die Teilskalen einfach anhand der Variablenkennung in der Auswertung zu Indizes zusammenfassen,
... ob Sie die Variablen zu den Items in der großen Skala im "Variablen" Karteireiter eventuell umbenennen, damit Sie sie einfacher zuordnen können oder
... ob Sie die Items auf unterschiedliche Fragen verteilen.
Alle (und vermutlich noch weitere) Lösungen sind möglich. Welche davon sie wählen, hängt primär davon ab, wie die Items im Fragebogen präsentiert werden sollen. Wenn beispielsweise abwechselnd Items aus den unterschiedlichen Teilskalen abgefragt werden sollen, dann is die Lösung mit separaten Fragen eher hinderlich.