Sie haben hier unterschiedliche Möglichkeiten.
Die einfachste Möglichkeit besteht darin, dass Sie unter "Fragebogen zusammenstellen" -> "Weitere Fragebögen" eine Kopie des ersten Fragebogens anlegen und die betroffenen Fragen in der Kopie austauschen (Sie müssen dafür im Fragenkatalog auch Kopien der betroffenen Fragen anlegen). Dann haben Sie zwei Links, die Sie an die beiden Zielgruppen versenden können. Das klappt natürlich nur, wenn Sie die Zielgruppen vorher unterscheiden können.
Wenn Sie die Zugehörigkeit zur Zielgruppe im Fragebogen abfragen, dann können Sie einfach mit Filtern arbeiten. Diese können entweder die einzelnen Fragen austauschen (also eine von zwei möglichen Fragen anzeigen - oder auch mal gar keine Frage, je nach Bedarf) - oder Sie arbeiten im Filter mit setPageOrder(), wenn es tatsächlich ein ganzer Block ist, der variiert wird.