Sie können die Variablen generell umbenennen - aber wenn Sie in mehreren Wellen dieselben Fragen verwenden, dann ist das Zusammenführen der Daten aus dem Long- ins Wide-Format eine klassische Aufgabe der Datenanalyse.
In R lassen sich die Variablen eines Teildatensatzes z.B. wie folgt alle auf einmal umbenennen:
names(ds) = paste("t1", names(ds), sep="_")
Aber es gibt auch spezielle Funktionen für long/wide format. In SPSS ist es ein wenig aufwändiger ;)