Es kommt darauf an, wie Sie es praktisch umsetzen. Falls Sie mit einer Unterbrecherseite arbeiten, hätten Sie tatsächlich ein Problem.
Wenn Sie mit unterschiedlichen Fragebögen arbeiten, langen dei Daten auch in unterschiedlichen Daten-Fällen (CASE) und Sie müssen sich in der Auswertung nur um das Umbenennen kümmern.
Ich empfehle hier dasselbe, was ich JEDER Befragung nur wärmstens ans Herz legen kann: Einen sauberen technischen Funktionstest. Das heißt im Fall einer mehrwelligen Erhebung, dass man die eigenen Mailadressen einträgt, sich die Einladungen schickt, alles ausfüllt, dann die Daten herunterlädt und prüft, ob alles funktioniert. Inklusive Zuordnung der Daten aus Welle 1 und Welle 2.