Kann ich die Anpassung der Nummerierung irgendwie manuell vornehmen, damit keine Lücken entstehen?
Ja, aber ich würde davon u.U. abraten.
Technisch können Sie in der Rubrik unter "Mehr" die "Frage-Kennungen entsprechend der Position anpassen".
Inhaltlich sollte man damit wenig aufpassen, denn wenn man im Fragebogen PHP-Filter programmiert hat, dann müssten diese angepasst werden.
Habe ich durch den Direktimport Nachteile bei meiner Auswertung im Vergleich dazu, wenn ich für jedes Item eine neue Frage angelegt hätte?
Wenn Sie eine Skala mit mehreren Items haben, dann sollten Sie diese auch innerhalb einer Frage anlegen - zumindest ist das so gedacht. Man kann natürlich auch mehrere Fragen anlegen, aber das hat vor allem Nachteile (schwerer zu verwalten, aufwändiger zu bearbeiten, ...).
Wenn Ihnen die Darstellung mit Item-Texten links und Auswahl-Optionen rechts nicht gefällt, dann können Sie in der Frage auch andere Darstellungsvarianten auswählen.