Am einfachsten erreichen Sie das dadurch, dass Sie mehrere Fragebogen-Layouts im Projekt anlegen/aktivieren/kopieren.
Dort ersetzen Sie in der "HTML-Vorlage des Layouts" den Platzhalter %logo% einfach gleich durch das Logo, das Sie anzeigen möchten, z.B.
<img src="../layout/logo01.png" alt="" class="s2-logo">
In Ihren Fragebögen können Sie in den "Einstellungen" dann jeweils festlegen, welches Layout (und damit welches Logo) der Fragebogen verwenden soll.