It's not a bug, it's a feature ;)
In der Vergangenheit hat sich gezeigt, dass sich einige Probleme vermeiden lassen, wenn die Softwar durchgehend mit einem einheitlichen Zeilenumbruch arbeitet. Und die Wahl fiel auf den CRLF. Entsprechend schreibt SoSci Survey die Konfiguration immer mit diesem Zeilenumbruch. SoSci Survey sollte dies aber eigentlich schon seit langer Zeit so machen.
Das in der anderen Frage dargestellte Problem gab es vor längerem mal, wenn der in der Konfiguration hinterlegte SoSci-Pfad einen Slash am Ende verwendete. Aber dieses Problem wurde eigentlich dereinst behoben, deshalb wundert es mich, dass es nun bei Ihnen auftritt... deshalb auch die Frage nach der SoSci-Version.